Phòng Vật lý biển được thành lập theo quyết định số 39/HDH-QD ngày 20 tháng 1 năm 1994 của Viện Hải Dương Học, có chức năng:

• Điều tra, nghiên cứu các quá trình tương tác biển – khí quyển ở vùng nhiệt đới.
• Điều tra, nghiên cứu sự phân bố, cấu trúc và biến động của các trường khí tượng – thuỷ văn, động lực học Biển Đông và dự báo ảnh hưởng của các quá trình đó lên môi trường và nguồn lợi biển.
• Điều tra, nghiên cứu các quá trình thủy thạch động lực học, tai biến thiên nhiên và môi trường dải ven bờ; đề xuất các biện pháp phòng chống, giảm nhẹ thiên tai.
• Tính toán các thông số và xây dựng các tiêu chuẩn kỹ thuật phục vụ thiết kế, xây dựng các công trình, khai thác nguồn lợi và các hoạt động trên biển.
• Mô hình hoá, tính toán và dự báo các quá trình khí tượng – thủy văn, động lực và thủy thạch động lực học biển.
• Lập luận chứng khoa học kỹ thuật cho việc xây dựng các công trình biển; tham gia vào việc qui hoạch sử dụng hợp lý các thủy vực ven bờ và cửa sông.
• Ứng dụng các phương pháp và thiết bị hiện đại trong nghiên cứu hải dương học. Tham gia đào tạo theo chuyên ngành hải dương học.

Phòng Vật lý biển gồm 07 cán bộ khoa học, trong đó:

• 02 Tiến sỹ
• 03 Thạc sỹ
• 02 Cử nhân